肺纤维化进展模型动态免疫图谱#
文章标题:Dynamic atlas of immune cells reveals multiple functional features of macrophages associated with progression of pulmonary fibrosis
发表期刊:Frontiers in Immunology(IF=7.3)
发表时间:2023.9
作者单位:清华大学
安诺优达为本研究合作分析作者,并提供了10X 单细胞建库、测序服务和分析服务
特发性肺纤维化(IPF)是一种病因不明、病程短暂且死亡率高的慢性间质性肺病,患者以老年人为主,发病率和患病率逐年上升。由于IPF疾病的不可逆性和目前缺乏有效治疗药物,患者的生活质量和心理状态受到了进一步的限制。免疫细胞,特别是巨噬细胞在IPF进展过程中被认为扮演着重要角色,但其在不同病程阶段的表征变化和功能特性尚未得到明确的解释。因此,深入了解巨噬细胞在IPF进展过程中的状态和功能改变的精细调控,将有助于发现并开发针对IPF的新疗法靶点。
实验设计#
实验结果#
01#
建立了小鼠肺纤维化的模型,构建了单细胞图谱,并分析了四个不同阶段(Day 0、7、14和21)的肺脏免疫细胞的动态单细胞景观。
02#
通过比较和分析免疫细胞间的相互作用,发现巨噬细胞在肺纤维化进展过程中发挥着核心的调控作用。
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肺泡巨噬细胞和单核细胞衍生的巨噬细胞(mo-Mac)在疾病进展过程中表现出高度的异质性和促纤维化基因表达的动态变化。
04#
进一步确定了与疾病状态相关的细胞簇,并发现Gpnmb和Trem2的基因水平随着纤维化进展而上调,提示其可能在肺纤维化中发挥重要调控作用。
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对比人类IPF的单细胞测序数据,发现小鼠模型中的巨噬细胞与IPF患者中的巨噬细胞在基因表达和代谢状态方面具有共性,为研究巨噬细胞的病理特征提供了新的见解,有助于研究巨噬细胞病理特征和寻找IPF治疗新靶点。